新化合物16-OH雷公藤红素的生物合成机制研究

    成果编号：9642024J0763
    第一完成单位名称：宁夏医科大学
    联系人：曹媛 联系人电话：15825370583
    成果简介：
    项目组采用Illumina HiSeq和PacBio相结合的测序方法，对LGT-5进行全基因组测序，获得了约55.07 Mb 的基因组序列，GC含量为52.16 %。总共预测到16,533个编码基因，平均序列长度为1,662.90 bp，占整个基因组序列长度的 49.93 %。发现了419个非编码RNA（ncRNA），占整个基因组长度的 0.10 %。重复序列的总长度为1,609,591 bp，占基因组长度的2.9230 %。共有16,533个基因通过各个数据库得到注释。AntiSMASH预测到LGT-5中存在鉴定出7个次生代谢物基因簇，包括3个T1PKS、1个NRPS、3个Terpene。筛选出2个可能对雷公藤红素具有羟化作用的基因（S1G00375.Trl和S10G12438.Trl）并成功构建异源表达体系。对目的基因进行功能初步验证，并对其发酵反应后的乙酸乙酯萃取物及进行TLC以及HPLC-Q-TOF-MS/MS分析，确定基因S10G12438.Trl为雷公藤红素16位羟化化作用的功能基因。本项目发表SCI论文2篇，北大核心1篇。