基于三代全长转录组水平对草石蚕生物学特性的研究

    成果编号：9642023J0716
    第一完成单位名称：宁夏农林科学院园艺研究所
    联系人：李程 联系人电话：13195092965
    成果简介：
    项目通过第三代测序获得高质量的草石蚕全长转录本信息，得到的FLNC序列的reads数为525593个转录本；KEGG、GO等七大数据库的基因功能注释中，在所有数据库中均注释成功的转录本数目为6857个；与GO数据库比对注释后，生物学过程、细胞成分与分子功能中注释到基因个数最多的分别是metabolic process5093个、cell2004个、binding6645个。通过Illumina Hiseq测序系统获得草石蚕不同发育阶段叶片及块茎的转录组信息，三个不同时期叶片的差异基因主要集中在光合作用生物的碳固定等通路上；三个不同时期块茎的差异基因主要集中在淀粉和蔗糖代谢、糖解与糖代谢合成等通路上。项目授权实用新型专利3项，发表论文1篇。